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（1）胃肠道反应：如恶心、呕吐、上腹不适、腹胀、腹泻等。
（2）肝脏损害：可引起严重肝脏损害。对肾功能下降者可加剧原有的肾功能不全，影响氨基酸代谢，从而增加氮血症。
（3）对骨、牙生长的影响：造成恒齿永久性棕色色素沉着（俗称牙齿黄染），牙釉质发育不全。可抑制胎儿、婴幼儿骨骼发育
（4）变态反应：可引起药热和皮疹等变态反应。
（5）二重感染：常见的二重感染有：
①真菌病，致病菌以白色念珠菌居多，表现为鹅口疮、肠炎。
②难辨梭菌引起的假膜性肠炎，由于厌氧的耐四环素的难辨梭菌产生毒性较强的外毒素，引起肠壁坏死，体液渗出，剧烈腹泻，导致失水或休克症状，有死亡危险。
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