在制定员工薪酬方案以确保内部公平性时，可以考虑以下方法：

1. 进行岗位评估：使用科学的岗位评估方法，如要素计点法、排序法等，对企业内的各个岗位进行评估，确定其相对价值和等级。

2. 建立薪酬等级体系：根据岗位评估结果，划分合理的薪酬等级，每个等级对应一定的薪酬范围，使相似价值的岗位处于相同或相近的薪酬等级。

3. 明确薪酬构成：统一薪酬的构成要素，如基本工资、绩效工资、津贴、奖金等，并明确各部分的计算方式和发放条件。

4. 绩效评估公正：建立客观、公正、透明的绩效评估体系，确保员工的绩效表现能够准确衡量，并与薪酬挂钩。

5. 考虑工作经验和技能：在确定薪酬时，充分考虑员工的工作经验、专业技能和知识水平等因素。

6. 透明沟通：向员工解释薪酬方案的设计原则、依据和计算方法，增加薪酬决策的透明度。

7. 定期审查与调整：定期审查薪酬方案的执行情况，根据企业发展、市场变化和员工反馈，对不合理的部分进行调整。

8. 防止特殊待遇：避免为个别员工设立特殊的薪酬待遇，除非有充分且合理的理由，并经过适当的审批和公示。

9. 同级对比分析：对处于同一等级或类似岗位的员工薪酬进行对比分析，确保差异在合理范围内。

10. 征求员工意见：在制定和修改薪酬方案过程中，征求员工代表的意见和建议，增强员工的参与感和认同感。