银行存款的内部控制制度就是指企、事业单位为维 护银行存款的完整性，确保会计记录的正确性和可靠性而对银行存款进行的结算、稽核 等自我调节和监督。
内部控制制度应遵循的基本原则。内部控制制度应遵守的基本原则是指企业和设 计内部控制制度时所必须遵守的客观规律和基本法则。
1、互相制约原则。是指在各部门、各岗位之间建立起一种相互验证或共同验证的 关系，分离经济业务执行和审查；分离经济业务记录和执行；分离财产保管和记录； 分离财产保管和财产核对；分离总账和明细账登记，从而达到自动纠错，防止舞弊现 象。
2、管辖范围原则。是指各部门、各岗位划分工作范围，职能范围，明确其相应的 权利和责任，做到有章可循，使各岗位、各部门协调，以达到实现内部控制。
3、成本效益原则。是指实行内部控制制度与实行它而产生的经济效益，合理确定 成本与效益的比例关系，既保证银行存款的安全完整，同时也达到对其控制管理目的。
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